AI 不再仅能识别蛋白质，现已能从零设计捕获药物的微型蛋白

《Nature》杂志最新公布了一项名为“神经迭代选择 – 扩增”（NISE）的突破性算法，它能从零开始设计出专门结合特定小分子药物的微型蛋白。研究团队已利用该技术成功设计出两种能精准锁定临床药物的小蛋白：一种是抗肿瘤药 exatecan，另一种是抗凝药 apixaban。

传统的计算方法往往难以同时优化蛋白质序列、三维结构以及药物分子的形态，而 NISE 算法通过两个神经网络模型的反复协作攻克了这一难题。其中一个模型负责根据预设的蛋白骨架和药物位置来设计氨基酸序列；另一个模型则依据生成的序列和药物身份，预测两者结合后的复合物结构。在每一轮循环中，系统会自动筛选并保留那些结构更自洽、可信度更高的方案，最终实现药物与蛋白的高效结合。这项成果为未来的药物研发和蛋白质工程开辟了全新的路径。